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醫(yī)學(xué)信息學(xué)基礎(chǔ)
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資源介紹
1. 第 1 章 概論
1.1. 概述
本章旨在介紹醫(yī)療衛(wèi)生領(lǐng)域計(jì)算機(jī)支持的概貌,所取得的成就反映在數(shù)據(jù)采集和解釋、決策
以及其他進(jìn)展方面。本章和以下各章節(jié)回顧計(jì)算機(jī)支持的各個(gè)方面,并且提供大量實(shí)例。
有意識(shí)的思考和推理往往發(fā)生在人類(lèi)的大多數(shù)行為之前,無(wú)論是科學(xué)行為還是日常工作
和生活,概莫能外。病人的醫(yī)療和醫(yī)學(xué)研究就是說(shuō)明人類(lèi)推理至關(guān)重要的一例。這種思考本
質(zhì)上需要在專(zhuān)家提供的知識(shí)幫助下,對(duì)現(xiàn)實(shí)世界的觀察或數(shù)據(jù)進(jìn)行解釋和理解。而原則上這
些數(shù)據(jù)和知識(shí)都能保存在計(jì)算機(jī)里,這就是現(xiàn)在計(jì)算機(jī)能幫助人類(lèi)推理的原因。
既然計(jì)算機(jī)能幫助人類(lèi)推理,就需要進(jìn)一步了解計(jì)算機(jī)在一般應(yīng)用和在醫(yī)療衛(wèi)生領(lǐng)域特
殊應(yīng)用中的優(yōu)點(diǎn)和局限性。因此,我們擬對(duì)以下情況進(jìn)行討論,即在醫(yī)療衛(wèi)生及其相關(guān)行為
中,諸如在醫(yī)學(xué)研究或者管理和計(jì)劃中,人的思考在何處以及如何得到計(jì)算機(jī)的支持。同樣
重要的是探索計(jì)算機(jī)在決策支持方面能起多大作 用,以及計(jì)算機(jī)與臨床醫(yī)生對(duì)病人方面的
責(zé)任有什么關(guān)系。
信息在解釋數(shù)據(jù)和決策中扮演了關(guān)鍵的角色。因此我們有必要懂得信息的含義并理解數(shù)
據(jù)、信息和知識(shí)之間的區(qū)別。本章及以下章節(jié)將討論怎樣獲得可靠的數(shù)據(jù),用什么方法從數(shù)
據(jù)中提煉信息,什么類(lèi)型的知識(shí)對(duì)解釋數(shù)據(jù)是必需的,以及怎樣把知識(shí)存儲(chǔ)到計(jì)算機(jī)中。圖
1-1 顯示臨床醫(yī)生在觀察病人或某一(生物的)過(guò)程中產(chǎn)生的數(shù)據(jù),并從這些數(shù)據(jù)中通過(guò)解
釋或推理得到信息的過(guò)程。而這些信息又指導(dǎo)臨床醫(yī)生采取進(jìn)一步措施。圖1-1 中,標(biāo)有"
信息"的箭頭表示反饋給臨床醫(yī)生的第一個(gè)循環(huán)。通過(guò)仔細(xì)地研究大量醫(yī)學(xué)方面諸如此類(lèi)的
解釋過(guò)程,或者通過(guò)收集來(lái)自大量病人的數(shù)據(jù)解釋?zhuān)詈髿w納推理得到新的見(jiàn)解和新的知識(shí)。
然后,這些知識(shí)又被增添到醫(yī)學(xué)知識(shí)體系中。反過(guò)來(lái),這些知識(shí)又可作為解釋其他數(shù)據(jù)的根
據(jù)。計(jì)算機(jī)在數(shù)據(jù)的收集、解釋和新知識(shí)的獲得方面也能起作用。由此表明,不僅數(shù)據(jù)和知
識(shí)能存儲(chǔ)在計(jì)算機(jī)里,而且計(jì)算程序的開(kāi)發(fā)可幫助采集和解釋數(shù)據(jù)。
本章第四部分是對(duì)計(jì)算機(jī)在醫(yī)療衛(wèi)生方面應(yīng)用的鳥(niǎo)瞰,顯示計(jì)算機(jī)在醫(yī)學(xué)方面的應(yīng)用有
許多潛力,但是也有其根本性限制。如果應(yīng)用于病人醫(yī)護(hù)將更是如此。這一介紹性?xún)?nèi)容試圖
提供一個(gè)思路,以便對(duì)醫(yī)療衛(wèi)生領(lǐng)域使用計(jì)算機(jī)的優(yōu)缺點(diǎn)方面能有一個(gè)清晰的輪廓。這個(gè)輪
廓將以復(fù)雜度,(即對(duì)人類(lèi)如醫(yī)生、護(hù)士、其他醫(yī)護(hù)人員和醫(yī)學(xué)研究者參與的依賴(lài)程度)劃
分層次勾畫(huà)出來(lái)
1.2. 診斷-治療循環(huán)
幾乎所有的人類(lèi)行為,我們都能分辨出三個(gè)階段:①觀察;②推理;③處理。 在人類(lèi)行為
中,這三個(gè)階段不僅在日常生活,而且在病人醫(yī)護(hù)、管理和研究中都起著作用。例如,如果
我們身處危險(xiǎn)或不愉快的境地,我們就會(huì)認(rèn)真觀察事實(shí)和環(huán)境,然后制定一個(gè)計(jì)劃擺脫這一
困境,如果可能的話(huà)就設(shè)法改善境況。又如,在戰(zhàn)場(chǎng)上將軍們盡可能收集關(guān)于軍隊(duì)情況的數(shù)
據(jù),制定一個(gè)戰(zhàn)略計(jì)劃并實(shí)施之。甚至他們可以預(yù)先在計(jì)算機(jī)上模擬戰(zhàn)爭(zhēng)情況和戰(zhàn)略計(jì)劃。
在科學(xué)研究中,也同樣存在這三個(gè)階段(表1-1)。調(diào)查者收集并觀察資料(測(cè)量值或數(shù)據(jù)),
得出一個(gè)基于假設(shè)的結(jié)論,并基于他的理論知識(shí)和推理得出一種解釋?zhuān)駴Q或修正這一理論,
最后制定一次新的科研或?qū)嶒?yàn)計(jì)劃以拓寬其知識(shí)。
在醫(yī)療衛(wèi)生領(lǐng)域中,在所謂的診療循環(huán)(圖1-2)中也能遇到相同的三個(gè)階段:①觀察;
②診斷;③治療。
表1-1 各領(lǐng)域人類(lèi)活動(dòng)的三個(gè)階段
人類(lèi)活動(dòng)領(lǐng)域
階段 普通行為 科學(xué)研究醫(yī)療衛(wèi)生 計(jì)算機(jī)處理
1 觀察 測(cè)量 病人數(shù)據(jù)采集 數(shù)據(jù)輸入
2 推導(dǎo) 理論形成 診斷 數(shù)據(jù)處理
3 行為 實(shí)驗(yàn) 治療 輸出生成
這個(gè)循環(huán)包括病人講述他/她的病史,臨床醫(yī)生收集數(shù)據(jù)(如作物理檢查、實(shí)驗(yàn)室檢查
或X 線(xiàn)透視)并得出一個(gè)結(jié)論,甚至可能得出診斷,然后開(kāi)出治療處方或者執(zhí)行其他治療。
醫(yī)療衛(wèi)生與科學(xué)研究不同,面對(duì)的不是解決抽象的一般化的問(wèn)題,而是要解決具體病人問(wèn)題。
這些問(wèn)題只有部分能被一般化。為了解決與病人有關(guān)的問(wèn)題,臨床醫(yī)生必須盡可能使用在科
學(xué)研究中已經(jīng)肯定的方法,但是必須永遠(yuǎn)面對(duì)現(xiàn)實(shí)的非抽象世界中每個(gè)病人的特殊問(wèn)題。因
此與病人有關(guān)的問(wèn)題不能用某種從病人的社會(huì)性抽象出來(lái)的方法解決。實(shí)際中,人類(lèi)行為的
三個(gè)階段經(jīng)常反復(fù)循環(huán),因?yàn)榭赡艹霈F(xiàn)先前的假設(shè)必須改進(jìn)或更改的情況。在作診斷或進(jìn)行
研究的過(guò)程中,到底何時(shí)何地在頭腦中突然迸發(fā)出創(chuàng)造性火花而獲得真知灼見(jiàn),仍是一個(gè)不
解之謎。就科學(xué)研究(包括醫(yī)學(xué)研究)來(lái)說(shuō),這一點(diǎn)更是明顯。經(jīng)過(guò)以上帶有哲理性的介紹
以后,有一點(diǎn)必須強(qiáng)調(diào),本書(shū)不是計(jì)算機(jī)編程教程,而是關(guān)于應(yīng)用計(jì)算機(jī)處理解決醫(yī)療衛(wèi)生
領(lǐng)域數(shù)據(jù)、信息和知識(shí)的參考書(shū)。它既涉及科學(xué)問(wèn)題,也涉及與病人有關(guān)的問(wèn)題。當(dāng)計(jì)算機(jī)
應(yīng)用于科學(xué)研究的時(shí)候,在醫(yī)學(xué)科學(xué)研究中的應(yīng)用與其他學(xué)科研究并無(wú)區(qū)別。然而,應(yīng)用計(jì)
算機(jī)解決與病人相關(guān)的問(wèn)題時(shí)就與在其他方面的應(yīng)用有所不同。鑒于這個(gè)原因,我們首先討
論在診療循環(huán)中的三個(gè)階段(圖1-2)。它簡(jiǎn)潔地描述了醫(yī)護(hù)人員在處理數(shù)據(jù)、信息和知識(shí)
中具有共性的臨床實(shí)踐。
(一)觀察
在觀察階段的任務(wù)是獲取數(shù)據(jù),更確切地說(shuō),是獲取能提供相關(guān)信息的數(shù)據(jù)(關(guān)于數(shù)據(jù)
和信息的區(qū)別等其他方面內(nèi)容,將在第2 章中討論)。簡(jiǎn)而言之,利用信息能夠減少關(guān)于
病人疾病的不確定性。在許多病例中,這種不確定性能通過(guò)參考病人的病史數(shù)據(jù)(既往病史)
得以減少;另外一些病例中,必須通過(guò)病人體格檢查、血樣分析或生物學(xué)信號(hào)的記錄(如心
電圖或呼吸描記圖)等途徑收集生理或生化數(shù)據(jù)。
收集數(shù)據(jù)時(shí),經(jīng)常會(huì)遇到不可忽視的數(shù)據(jù)不規(guī)則性,諸如病人的回答不全面或不正確,
生物學(xué)信號(hào)的噪聲,或者生化分析的錯(cuò)誤(參閱第2 章)。許多病例中,由于不能通過(guò)無(wú)
創(chuàng)傷的診斷手段進(jìn)行觀察,因而無(wú)法獲得相關(guān)的數(shù)據(jù)。只有在某些情況下,醫(yī)生才會(huì)決定做
侵入性探查(例如用導(dǎo)管、內(nèi)鏡等)或者通過(guò)活組織檢查取得標(biāo)本以收集數(shù)據(jù)。而有些疾病,
病程是不穩(wěn)定的,是動(dòng)態(tài)的,其病程特點(diǎn)在不斷地變化。譬如,期外收縮病人、休克病人或
者癲癇發(fā)作病人就可能出現(xiàn)這種情況。
幫助解釋來(lái)自病人的數(shù)據(jù)對(duì)于醫(yī)學(xué)信息學(xué)來(lái)說(shuō)是一個(gè)挑戰(zhàn)。本章的第四部分和以下的章
節(jié)列舉了眾多例子,說(shuō)明通過(guò)使用計(jì)算機(jī)可獲得對(duì)診斷和治療非常重要的參數(shù)。
用完全不同的方式得到的病人數(shù)據(jù)常?上嗷パa(bǔ)充和相互佐證,以得出更加可靠的診斷
(例如:病史、運(yùn)動(dòng)心電圖、冠狀動(dòng)脈血管造影和超聲心動(dòng)圖等對(duì)心肌缺血性心臟病的診斷)。
而有時(shí)在處理時(shí)數(shù)據(jù)太多以致我們不得不面對(duì)數(shù)據(jù)冗余問(wèn)題。實(shí)際上,在診療循環(huán)的每一個(gè)
途徑,臨床醫(yī)生都盡力減少病人的疾病或者病程的不確定性。鑒于上述原因,如果可能,診
療循環(huán)的第一步總是獲得病人的病史,接著優(yōu)先考慮費(fèi)用低的手段(如體檢或?qū)嶒?yàn)室檢查),
最后才考慮費(fèi)用高的和損傷性的方法,如磁共振成像(MRI)或心導(dǎo)管插入。在絕大多數(shù)情
況下,通過(guò)使用不同方式和不同方法得到的數(shù)據(jù),就能獲得關(guān)于病人狀況的全貌。醫(yī)學(xué)信息
學(xué)的任務(wù)就是幫助臨床醫(yī)生獲得必需的數(shù)據(jù),提供決策支持的方法,以便使診療循環(huán)得以有
效地進(jìn)行并盡可能保證服務(wù)質(zhì)量和減少病人麻煩。
(二)診斷
第15~18 章將講述計(jì)算機(jī)和診斷之間的關(guān)系。因此,本章只作初步的介紹性的描述。
準(zhǔn)確診斷的先決條件是治療醫(yī)生的周密思考。計(jì)算機(jī)在診斷階段可以有很多應(yīng)用,然而,這
僅僅限于診斷的可結(jié)構(gòu)化、可一般化和可客觀化部分。換言之,是基于能科學(xué)地結(jié)構(gòu)化的那
一部分。臨床醫(yī)生經(jīng)常不在意他不知道的東西,計(jì)算機(jī)產(chǎn)生的列表可以提示并引起他注意。
例如,計(jì)算機(jī)能幫助從文獻(xiàn)中找出必需的背景信息。
臨床醫(yī)生要對(duì)病人負(fù)責(zé),因此必須對(duì)診斷負(fù)責(zé)。但是,當(dāng)使用計(jì)算機(jī)支持時(shí),絕不允許
用計(jì)算機(jī)取代人類(lèi)(臨床醫(yī)生)對(duì)診斷的負(fù)責(zé)。因此,客觀的和基于科學(xué)的部分可以交給計(jì)
算機(jī)去做,而處理病人獨(dú)特的和個(gè)體的問(wèn)題不能也不應(yīng)該交給機(jī)器。例如,一個(gè)診斷總是帶
有某種程度的主觀因素,那些因素永遠(yuǎn)不可能一般化,永遠(yuǎn)不能交給計(jì)算機(jī)去做。初看起來(lái),
似乎在診斷和治療病人中臨床醫(yī)生的實(shí)踐經(jīng)驗(yàn)是高度主觀性的,不可能為計(jì)算機(jī)所代替。但
這僅說(shuō)對(duì)了一部分,其實(shí),即使是存儲(chǔ)在人腦中的知識(shí)和經(jīng)驗(yàn)(盡管只有部分內(nèi)容并且只在
某種程度上)也能被結(jié)構(gòu)化并用計(jì)算機(jī)來(lái)處理(如知識(shí)庫(kù),參閱第15 章)。
(三)治療
治療階段需要的臨床知識(shí)和經(jīng)驗(yàn)與診斷階段不同;治療的特點(diǎn)是人類(lèi)行為的實(shí)踐性,它
較多地受決策控制,而較少地受理論思維控制。治療階段依賴(lài)于前階段的結(jié)果,即診斷和決
策分析(參閱第18 章)中所提示的可能預(yù)后(即病人將來(lái)最可能的結(jié)果)。
通常治療是由內(nèi)科醫(yī)生或護(hù)士處理的,而診斷還可由其他醫(yī)務(wù)人員作出。例如提供治療
的有外科和放射治療。很難想象外科和探查行為能完全由計(jì)算機(jī)和機(jī)器人取代。但是,治療
的準(zhǔn)備和監(jiān)護(hù)卻可以得到計(jì)算機(jī)支持。后者的例子是藥物管理(劑量、可能存在的藥物之間
的反應(yīng)或禁忌癥)和危重病人或放射治療的監(jiān)護(hù)。盡管這些例子都直接與病人醫(yī)護(hù)有關(guān),但
是計(jì)算機(jī)也能用于分析來(lái)自許多病人的大量數(shù)據(jù)并通過(guò)歸納而得出結(jié)論(參見(jiàn)圖1-1)。這
樣的分析,有時(shí)被稱(chēng)為"數(shù)據(jù)采掘"(data mining)(參閱第22 章),可應(yīng)用于流行病學(xué)、
醫(yī)療衛(wèi)生服務(wù)情況研究、決策分析和醫(yī)學(xué)科研中。對(duì)于不同治療的評(píng)估,計(jì)算機(jī)的應(yīng)用也不
可或缺,因?yàn)樵谠S多情況下必須做對(duì)照分析以觀察療效。
1.3. 信息處理
在第3 章中,我們將討論信息處理系統(tǒng)的結(jié)構(gòu),試圖闡明人類(lèi)和機(jī)器在處理信息上的相
似性和相異性。在用計(jì)算機(jī)進(jìn)行信息處理時(shí)我們也能看到與上述相同的三個(gè)階段:①測(cè)量和
數(shù)據(jù)輸入;②數(shù)據(jù)處理;③結(jié)果產(chǎn)生(參見(jiàn)表1-1)。
實(shí)際上,只有當(dāng)人們以某種方式參與進(jìn)來(lái)時(shí),才談得上信息處理。計(jì)算機(jī)不會(huì)處理信息,
只會(huì)處理數(shù)據(jù)。只有人類(lèi)能夠解釋數(shù)據(jù)使其成為信息。計(jì)算機(jī)輔助獲取數(shù)據(jù)和人類(lèi)感官獲取
數(shù)據(jù),兩者之間有相似性(參閱第2 章)。計(jì)算機(jī)處理過(guò)程與人腦思考過(guò)程也有相似性。
但正如上文所述,這僅僅限于能結(jié)構(gòu)化和一般化的信息處理部分。在醫(yī)療衛(wèi)生領(lǐng)域中,計(jì)算
機(jī)不能也不應(yīng)該代替人腦的思考過(guò)程,而應(yīng)該用在增強(qiáng)人腦的能力方面。計(jì)算機(jī)能夠擴(kuò)展人
腦的記憶力,提高它的數(shù)據(jù)處理能力和提高數(shù)據(jù)處理的精確性和一致性。正如人類(lèi)的感覺(jué)能
被顯微鏡或聽(tīng)診器放大一樣,人腦的能力也能被計(jì)算機(jī)放大。
在計(jì)算機(jī)信息處理的框架中,人類(lèi)的特殊任務(wù)是采取初步行動(dòng),準(zhǔn)
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